Το Τμήμα Ιατρικής του Πανεπιστημίου Iωαννίνων οργανώνει και λειτουργεί Mεταπτυχιακό Πρόγραμμα Σπουδών (ΠMΣ) «Βασικών Βιοϊατρικών Επιστημών (ΒΒΕ)» με τη συμμετοχή επτά (7) Εργαστηρίων του Ιατρικού Τμήματος της Σχολής Επιστημών Υγείας. Σκοπός του ΠΜΣ είναι η παροχή μεταπτυχιακής εκπαίδευσης στην βιοϊατρική και η προετοιμασία επιστημόνων για άριστη σταδιοδρομία στους τομείς της και για το μεταπτυχιακό πρόγραμμα συνεργάζονται τα Εργαστήρια 

• Ανατομίας-Ιστολογίας,
• Βιολογίας,
• Βιολογικής Χημείας,
• Κλινικής Χημείας,
• Μικροβιολογίας,
• Φαρμακολογίας,
• Φυσιολογίας

Tο ΠMΣ απονέμει Μεταπτυχιακό Δίπλωμα Ειδίκευσης (ΜΔΕ, Master) στον τομέα των Βασικών Βιοϊατρικών Επιστημών με 3 διαφορετικές ειδικεύσεις.

• Γενετική – Κυτταρογενετική-Γενετική Επιδημιολογία.
• Βλαστικά κύτταρα – Γονιδιακή-Κυτταρική θεραπεία (Αναγεννητική Ιατρική).
• Εφηρμοσμένη Βιοϊατρική (Κλινική Χημεία, Μικροβιολογία, Φαρμακολογία).

Δεν υπάρχουν δίδακτρα, οι σπουδές είναι εντατικές, πλήρους απασχόλησης και διαρκούν 3 συνολικά εξάμηνα.